MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp4

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021234	TCA	2	6	3	8	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021234	TGGT	2	8	9	16	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021234	TGT	2	6	106	111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021234	TGG	2	6	194	199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021234	GT	3	6	240	245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021234	TGA	2	6	370	375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021234	ATC	2	6	426	431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021234	T	6	6	1113	1118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021234	ACG	2	6	1608	1613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021234	T	7	7	1656	1662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021234	GTA	2	6	1783	1788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021234	ACG	2	6	1830	1835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021234	CTC	2	6	1929	1934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021234	CAG	2	6	1963	1968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021234	TGAT	2	8	2002	2009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021234	ATT	2	6	2029	2034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021234	AAT	2	6	2047	2052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021234	CTTCA	2	10	2070	2079	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_021234	TTTA	2	8	2126	2133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021234	A	6	6	2159	2164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021234	ATA	2	6	2605	2610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021234	ACT	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021234	TAA	2	6	2679	2684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021234	TCA	2	6	2716	2721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021234	TAG	2	6	2750	2755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021234	AGC	2	6	2784	2789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021234	TTA	2	6	2851	2856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021234	TAA	2	6	2857	2862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021234	ATT	2	6	2895	2900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021234	GTT	2	6	2962	2967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021234	ACT	2	6	2976	2981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021234	TTGC	2	8	5027	5034	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021234	ATT	2	6	5046	5051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021234	GAA	2	6	5087	5092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021234	CAT	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021234	AAG	2	6	5132	5137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021234	TCA	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021234	AAT	2	6	5658	5663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021234	A	6	6	5707	5712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021234	CATT	2	8	6713	6720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021234	CTAT	2	8	7219	7226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021234	AGG	2	6	7273	7278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021234	TGA	2	6	7504	7509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021234	TAA	2	6	7520	7525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021234	T	6	6	7531	7536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021234	CA	3	6	7832	7837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021234	T	7	7	7864	7870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021234	CAG	2	6	7914	7919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021234	TAT	2	6	7925	7930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021234	AAAAT	2	10	7978	7987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021234	CTTA	2	8	8005	8012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021234	GATTT	2	10	8086	8095	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021234	TAG	2	6	8155	8160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021234	TC	3	6	8166	8171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021234	TAT	2	6	8336	8341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021234	CTG	2	6	8373	8378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021234	CTC	2	6	8385	8390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_021234	A	7	7	8404	8410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021234	ATA	2	6	9469	9474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021234	AAT	2	6	9525	9530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021234	CTTT	2	8	9539	9546	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021234	GCC	2	6	9573	9578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021234	AAT	2	6	9609	9614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021234	ATGA	2	8	9639	9646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021234	ACC	2	6	9956	9961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_021234	AGCGA	2	10	10261	10270	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021234	CAG	2	6	10302	10307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021234	AC	3	6	10337	10342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021234	AAC	2	6	10343	10348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021234	GTTG	2	8	10353	10360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021234	ACA	2	6	10403	10408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021234	AAAG	2	8	10428	10435	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021234	AAATC	2	10	12522	12531	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021234	GTT	2	6	15809	15814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021234	AAC	2	6	15870	15875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021234	AGCAA	2	10	15886	15895	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021234	CCG	2	6	17299	17304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_021234	TA	3	6	17359	17364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021234	GTC	2	6	17368	17373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021234	T	6	6	17406	17411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021234	GAG	2	6	17437	17442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021234	ATT	2	6	17522	17527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021234	CCTCA	2	10	17543	17552	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NC_021234	TAT	2	6	23719	23724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021234	GACTA	2	10	23869	23878	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_021234	AC	3	6	23948	23953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021234	TA	3	6	26110	26115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021234	AACAC	2	10	26152	26161	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_021234	AGTC	2	8	26196	26203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021234	AGA	2	6	26410	26415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021234	AT	3	6	26420	26425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021234	T	8	8	26425	26432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021234	T	6	6	26442	26447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021234	CCT	2	6	26451	26456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_021234	CTA	2	6	26502	26507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021234	TGA	2	6	26512	26517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021234	TAC	2	6	26631	26636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021234	TTC	2	6	26658	26663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021234	T	6	6	26699	26704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021234	CGT	2	6	27286	27291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021234	CCA	2	6	27344	27349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_021234	GCC	2	6	27511	27516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_021234	CAA	2	6	27567	27572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021234	ACG	2	6	27579	27584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021234	T	7	7	27627	27633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021234	GTA	2	6	27754	27759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021234	ACG	2	6	27801	27806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021234	CTC	2	6	27900	27905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_021234	CAG	2	6	27934	27939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021234	T	7	7	28052	28058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021234	ATT	2	6	28091	28096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021234	TAA	2	6	28115	28120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021234	GGA	2	6	28162	28167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021234	TGC	2	6	28635	28640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021234	TCAT	2	8	28701	28708	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021234	TGG	2	6	28755	28760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021234	CA	3	6	28785	28790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021234	AAT	2	6	28913	28918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021234	GATATG	2	12	29033	29044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021234	ATG	3	9	29057	29065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021234	ATG	2	6	29078	29083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021234	TTG	2	6	29202	29207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021234	ATC	2	6	29213	29218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021234	TTTG	2	8	29221	29228	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021234	ACTTT	2	10	29236	29245	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_021234	ATG	2	6	29306	29311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021234	CAA	2	6	29371	29376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021234	CTT	2	6	29377	29382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021234	TTCG	2	8	29410	29417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021234	AATG	2	8	29464	29471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021234	GGC	2	6	29506	29511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021234	AAG	2	6	29559	29564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021234	TTA	2	6	29637	29642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021234	TGAA	2	8	29661	29668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021234	CTG	2	6	29688	29693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021234	TGG	2	6	29725	29730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021234	CAAC	2	8	29733	29740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021234	AGA	2	6	29845	29850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021234	ATT	2	6	29903	29908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021234	CTTT	2	8	29910	29917	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021234	TTGC	2	8	29976	29983	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021234	GCAT	2	8	29986	29993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021234	CTA	2	6	30027	30032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021234	ATG	2	6	30168	30173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021234	TTA	2	6	30191	30196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021234	GCC	2	6	30206	30211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_021234	AAT	2	6	30218	30223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021234	GCT	2	6	30407	30412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_021234	GCT	2	6	30422	30427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_021234	AATT	2	8	30516	30523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021234	GAT	2	6	30641	30646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021234	ATT	2	6	30656	30661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.